Заикин Алексей Анатольевич

Место работы

Институт информационных технологий, математики и механики

Кафедра прикладной математики

профессор

Ученая степень
Кандидат физико-математических наук
Ученое звание
нет
Дата начала работы в Университете Лобачевского: 2012
Общий стаж работы 13 лет

Общие сведения

Преподавание

Научная Работа


Образование, учёные степени и учёные звания

Высшее образование
специалист. Специальность: Физика. Квалификация: физик.

Дополнительное образование, повышение квалификации, стажировки

16.09.2019 - 06.12.2019
Переподготовка: Актуальные проблемы исследования и современные технологии преподавания математики, механики и информатики, ННГУ, 250 час., документ № 522409110652, рег номер 33-987 от 06.12.2019

23.04.2018 - 11.05.2018
Повышение квалификации: Электронная информационно-образовательная среда вуза, ННГУ, 72 час., документ № удостоверение № 522406997973, рег. № 33-2791 от 11.05.2018

16.01.2018 - 16.01.2018
Повышение квалификации: Оказание первой помощи, ННГУ, 8 час., документ № Рег. № 507 от 16.01.2018

03.04.2017 - 30.05.2017
Повышение квалификации: Дистанционные образовательные технологии, ННГУ, 72 час., документ № 522404997776 рег номер 33-1691 от 30.05.2017

24.07.2016 - 08.08.2016
Повышение квалификации: Проблемы и перспективы развития нейронаучных исследований, ННГУ, 40 час., документ № 522403228140 рег номер 33-1022 от 08.08.2016

Список преподаваемых дисциплин

Институт информационных технологий, математики и механики
Введение в биоинформатику
Индивидуальные консультации
Контроль самостоятельной работы
Математические методы биоинформатики
Математические методы биоинформатики - 2
Математические методы биоинформатики-1
Математические методы биоинформатики-2
Популяционная генетика
Современные проблемы ПМИ

Публикации

2021

Труды (тезисы) конференции

Tsybina Yu.A., Gordleeva S.Yu., Krivonosov M.I., Kastalskiy I.A., Zaikin A.A., Gorban A.N. Modelling Working Memory in Neuron-Astrocyte Network // 2021 IEEE International Joint Conference on Neural Networks (IJCNN), Shenzhen, China. IEEE Xplore. 2021. P. 1-6.

Цыбина Ю.А., Гордлеева С.Ю., Кривоносов М.И., Заикин А.А., Горбань А.Н., Иванченко М.В. Моделирование рабочей памяти в нейрон-астроцитарных сетях // XXV научная конференция по радиофизике 2021. Национальный исследовательский Нижегородский государственный университет им. Н.И. Лобачевского (Нижний Новгород). 2021. [принято к печати]

Tsybina Yu.A., Gordleeva S.Yu., Krivonosov M.I., Zaikin A.A., Gorbany A.N. MODELLING WORKING MEMORY IN NEURON-ASTROCYTE NETWORKS // VOLGA NEUROSCIENCE MEETING 2021. Национальный исследовательский Нижегородский государственный университет им. Н.И. Лобачевского (Нижний Новгород). 2021. P. 85-86. [принято к печати]

Публикации в научных журналах

Abrego L., Gordleeva S.Yu., Kanakov O.I., Krivonosov M.I., Zaikin A.A. Estimating integrated information in bidirectional neuron-astrocyte communication // Physical Review E. № 2. V. 103. 2021. P. 022410.

Vershinina O.S., Bakalini M.G., Zaikin A.A., Franceschi C., Ivanchenko M.V. Disentangling age-dependent DNA methylation: deterministic, stochastic, and nonlinear // Scientific Reports. № 11. 2021. P. 9201.

Gordleeva S.Yu., Tsybina Yu.A., Krivonosov M.I., Ivanchenko M.V., Zaikin A.A., Kazantsev V.B., Gorbany A.N. Modeling Working Memory in a Spiking Neuron Network Accompanied by Astrocytes // Frontiers in Cellular Neuroscience. V. 15. 2021. P. 86.

2020

Труды (тезисы) конференции

Krivonosov M.I., Nazarenko T., Bacalini M.G., Zaikin A.A., Ivanchenko M.V., Francheski K. Network markers of DNA methylation in neurodegenerative diseases // Материалы IV Международной школы-конференции молодых учёных «Динамика сложных сетей и их применение в интеллектуальной робототехнике». IEEE. P. 138-139. 2020. P. 2.

Tsybina Yu.A., Krivonosov M.I., Gordleeva S.Yu., Zaikin A.A., Gorbany A.N. Short-term memory in neuron-astrocyte network // Материалы IV Международной школы-конференции молодых учёных «Динамика сложных сетей и их применение в интеллектуальной робототехнике».. IEEE. P. 245-247. 2020. P. 3.

Кривоносов М.И., Назаренко Т., Бакалини М.Дж., Франчески К., Заикин А.А., Иванченко М.В. Выделение эпигенетических маркеров старения на основе паренклитических сетей метилирования пациентов с синдромом Дауна // Тезисы докладов 73-й Всероссийской с международным участием школы-конференции молодых ученых. Нижний Новгород, 2020. С.111. 2020. С. 1.

Кривоносов М.И., Цыбина Ю.А., Заикин А.А., Горбань А.Н., Иванченко М.В. Кратковременная рабочая память в нейрон-астроцитарной сети // Математическое моделирование и суперкомпьютерные технологии. Труды XX Международной конференции. под ред. проф. В.П. Гергеля. Нижний Новгород, 2020. С. 407-408. 2020. С. 2.

Цыбина Ю.А., Гордлеева С.Ю., Кривоносов М.И., Заикин А.А., Иванченко М.В. Ассоциативная память в модели нейрон-астроцитарной сети // НЕЛИНЕЙНЫЕ ВОЛНЫ - 2020 Тезисы докладов XIX научной школы. 2020. Институт прикладной физики Российской академии наук (Нижний Новгород). 2020. С. 275-276.

Публикации в научных журналах

Zaikin A.A., Aleksandra Gentry-Maharaj, Oleg Blyuss, Andy Ryan, Matthew Burnell, Chloe Karpinskyj, Richard Gunu, Jatinderpal K. Kalsi, Anne Dawnay, Ines P. Marino, Ranjit Manchanda, Karen Lu, Wei-Lei Yang, John F. Timms, Mahesh Parmar, Steven J. Skates Multi-Marker Longitudinal Algorithms Incorporating HE4 and CA125 in Ovarian Cancer Screening of Postmenopausal Women // Cancers. № 7. V. 12. 2020. P. 1931.

Whitwell Harry J., Bacalini Maria Giulia, Blyuss Oleg, Chen Shangbin, Garagnani Paolo, Gordleeva S.Yu., Jalan Sarika, Ivanchenko M.V., Kanakov O.I., Kustikova V.D., Mariño Ines P., Meyerov I.B., Ullner Ekkehard, Franceschi Claudio, Zaikin A.A. The Human Body as a Super Network: Digital Methods to Analyze the Propagation of Aging // Frontiers in Aging Neuroscience. V. 12. 2020. P. 136.

Zaikin A.A., Shangbin Chen Editorial: Multiscale Modeling of Rhythm, Pattern and Information Generation: from Genome to Physiome // Frontiers in Physiology. V. 11. 2020. P. 1.

Zaikin A.A., Harry J. Whitwell, Jenny Worthington, Oleg Blyuss, Aleksandra Gentry-Maharaj, Andy Ryan, Richard Gunu, Jatinderpal Kalsi, Usha Menon, Ian Jacobs, John F. Timms Improved early detection of ovarian cancer using longitudinal multimarker models // British Journal of Cancer. № 6. V. 122. 2020. P. 847-856.

Ivanchenko M.V., Gordleeva S.Yu., Kanakov O.I., Zaikin A.A., Francheski K. Brain aging and garbage cleaning: Modelling the role of sleep, glymphatic system, and microglia senescence in the propagation of inflammaging // Seminars in Immunopathology. 2020. P. 10.

2019

Труды (тезисы) конференции

Gordleeva S.Yu., Lotareva Y.A., Krivonosov M.I., Zaikin A.A., Ivanchenko M.V., Gorbany A.N. Astrocytes Organize Associative Memory // Advances in Neural Computation, Machine Learning, and Cognitive Research III: Selected Papers from the XXI International Conference on Neuroinformatics, October 7–11, 2019, Dolgoprudny, Moscow Region, Russia. Kryzhanovsky B., Dunin-Barkowski W., Redko V., Tiumentsev Y. (eds), Studies In Computational Intelligence, 384-391, Springer, Cham, 2019. 2019. P. 384-391.

Makovkin S.Yu., Ivanchenko M.V., Zaikin A.A., Dzhalan S. S. Makovkin, M. Ivanchenko, A. Zaikin, S. Jalan. Investigating multiplex models of neuron-glial systems: small-world topology and inhibitory coupling. // PHYSCON 2019, Innopolis, Russia, 8–11 September, 2019. Http://www.spsl.nsc.ru/FullText/konfe/PhysCon2019.pdf PHYSCON 2019, Innopolis, Russia, 8–11 September, 2019. 2019. P. 184-186.

Маковкин С.Ю., Иванченко М.В., Заикин А.А., Джалан С. РОЛЬ ИНГИБИТОРНЫХ ОСЦИЛЛЯТОРОВ В МУЛЬТИПЛЕКСНЫХ АНСАМБЛЯХ МОДЕЛЕЙ НЕЙРОН-ГЛИАЛЬНЫХ СИСТЕМ С.Ю. Маковкин, М.В. Иванченко, А.А. Заикин, С. Джалан // Труды XXIII Научной конференции по радиофизике, ННГУ, 2019. Труды XXIII Научной конференции по радиофизике, ННГУ, 2019. 2019. С. 243-245.

Gordleeva S.Yu., Zaikin A.A., Gorbany A.N., Krivonosov M.I., Tsybina Yu.A., Ivanchenko M.V. Astrocytes organize associative memory // 21st International Conference on Neuroinformatics, 2019; Dolgoprudny; Russian Federation;. Studies in Computational Intelligence Volume 856, 2020, Pages 384-391 21st International Conference on Neuroinformatics, 2019; Dolgoprudny; Russian Federation; 7 October 2019 до 11 October 2019; Код 231619. 2019. P. 384-391.

Цыбина Ю.А., Гордлеева С.Ю., Кривоносов М.И., Заикин А.А., Горбань А.Н., Иванченко М.В. Ассоциативная память в простейшей модели нейрон-астроцитарной сети // ТРУДЫ XXIII НАУЧНОЙ КОНФЕРЕНЦИИ ПО РАДИОФИЗИКЕ, ПОСВЯЩЕННОЙ 100-ЛЕТИЮ СО ДНЯ РОЖДЕНИЯ Н.А. ЖЕЛЕЗЦОВА. Национальный исследовательский Нижегородский государственный университет им. Н.И. Лобачевского (Нижний Новгород). 2019. С. 239-242.

Публикации в научных журналах

Kanakov O.I., Gordleeva S.Yu., Ermolaeva A.V., Jalan S., Zaikin A.A. Astrocyte-induced positive integrated information in neuron-astrocyte ensembles // Physical Review E. № 1. V. 99. 2019. P. 012418.

Ivanchenko M.V., Dzhalan S., Zaikin A.A. Symmetry in cancer networks identified: Proposal for multicancer biomarkers // Network Science. № 4. V. 7. 2019. P. 541.

Zaikin A.A., Oleg Blyuss, Valeriia Cherepanova, Daniel Munblit, Elena M. Kiseleva, Olga M. Prytomanova, Stephen W. Duffy, Tatjana Crnogorac-Jurcevic Development of PancRISK, a urine biomarker-based risk score for stratified screening of pancreatic cancer patients // British Journal of Cancer. № 5. V. 122. 2019. P. 692-696.

Zaikin A.A., Abrego Luis Integrated information as a measure of cognitive processes in coupled genetic repressilators // Entropy. № 4. V. 21. 2019. P. 382.

2018

Труды (тезисы) конференции

Kustikova V.D., Krivonosov M.I., Denisov P.A., Zaikin A.A., Ivanchenko M.V., Meerov I.B., Semyyanov A.V. Time-lapse imaging for calcium activity analysis in astrocytes with automatic video processing // Opera Medica et Physiologica. Vol. 4 (S1). 2018. P. P. 82.

Публикации в научных журналах

Kustikova V.D., Krivonosov M.I., Pimashkin A.S., Denisov P.A., Zaikin A.A., Ivanchenko M.V., Meyerov I.B., Semyyanov A.V. CalciumCV: Computer vision software for calcium signaling in astrocytes // Lecture Notes in Computer Science. V. 11179. 2018. P. 168-179.

Ivanchenko M.V., Francheski K., Zaikin A.A., Gordleeva S.Yu., F. Bonifazi, G. Storci, M. Bonafè Inflammaging 2018: An update and a model // Seminars in Immunology. V. 40. 2018. P. 1.

Zaikin A.A., Inés P. Marino, Oleg Blyuss, Andy Ryan, Aleksandra Gentry-Maharaj, Jatinderpal Kalsi, Ranjit Manchanda, Ian Jacobs, Usha Menon, Manuel A. Vázquez A Quantitative performance study of two automatic methods for the diagnosis of ovarian cancer // Biomedical Signal Processing and Control. № 2018. V. 46. 2018. P. 86-93.

Zaikin A.A., Nuno R. Nené, James Rivington Sensitivity of asymmetric rate-dependent critical systems to initial conditions: Insights into cellular decision making // Physical Review E. № 2. V. 98. 2018. P. 1-4.

2017

Публикации в научных журналах

Zaikin A.A., Karsakov A.S., Ivanchenko M.V., Meerov I.B., Ryblov A.M., T. Bartlett Parenclitic network analysis of methylation data for cancer identification // PLoS One. № 1. V. 21. 2017. P. E0169661.

Makovkin S.Yu., A. Kumar, Zaikin A.A., S. Jalan, Ivanchenko M.V. Multiplexing topologies and time scales: The gains and losses of synchrony // Physical Review E - Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. V. 96. 2017. P. 052214.

2016

Публикации в научных журналах

D. Nesbeth, Zaikin A.A., Y. Saka, M. Romano, C. Giuraniuc, Kanakov O.I., Lapteva T.. Engineering complexity: synthetic biology routes to bio-artificial intelligence // Essays in Biochemistry. V. 60. 2016. P. 381-391.

Samborska V., Gordleeva S.Yu., Ullner E., Lebedeva A.V., Kazantsev V.B., Ivanchenko M.V., Zaikin A.A. Mammalian Brain As a Network of Networks // Opera Medica et Physiologica. № 2. V. 9. 2016. P. 141-145.

Polovinkin A.N., Krylov I.B., Druzhkov P.N., Ivanchenko M.V., Meerov I.B., Zaikin A.A., Zolotykh N.Yu. Solving Problems of clustering and classification of cancer diseases based on DNA methylation data // Pattern Recognition and Image Analysis. № 1. V. 26. 2016. P. 2016.

Filicheva S.Yu., Zaikin A.A., Kanakov O.I. Dynamical decision making in a genetic perceptron // Physica D: Nonlinear Phenomena. V. 318-3. 2016. P. 112-115.

2015

Труды (тезисы) конференции

Polovinkin A.N., Krylov I.B., Druzhkov P.N., Ivanchenko M.V., Meyerov I.B., Zaikin A.A., Zolotykh N.Yu. Solving Problems of Clustering and Classification of Cancer Diseases Based on DNA Methylation Data // Proceedings of the 9th Open German-Russian Workshop on Pattern Recognition and Image Understanding (December 1-5, 2014 Koblenz, Germany). Active Vision Group (AGAS). 2015. P. 234-237.

Публикации в научных журналах

Ivanchenko M.V., Kotelynikov R.A., Kanakov O.I., Zaikin A.A., A. Alsaedi, R. Huerta, L. Tsimring Multi-Input Distributed Classifiers for Synthetic Genetic Circuits // PLoS ONE. № 5. V. 10. 2015. P. E0125144.

Zaikin A.A., Ashwin P. Pattern selection: the importance of “how you get there” // Biophysical Journal. V. 108. 2015. P. 1307.

Zaikin A.A., Bates R., Blyuss O., Alsaedi A. Effect of noise in intelligent cellular decision making // PLoS ONE. № 5. V. 10. 2015. P. E0125079.

Druzhkov P.N., Zolotykh N.Yu., Meerov I.B., Alsaedi A., Shutova M., Ivanchenko M.V., Zaikin A.A. Variations in the intra-gene methylation profiles hallmark induced pluripotency // BioMed Research International. № 976362. V. 2015. 2015. P. 976362.

2014

Труды (тезисы) конференции

Polovinkin A.N., Krylov I.B., Druzhkov P.N., Zolotykh N.Yu., Ivanchenko M.V., Meyerov I.B., Zaikin A.A. Solving Problems of Clustering and Classification of Cancer Diseases Based on DNA Methylation Data // 9-th Open German-Russian Workshop on PATTERN RECOGNITION and IMAGE UNDERSTANDING. December 1st-5th, 2014 in Koblenz, Germany. 2014. [принято к печати]

Публикации в научных журналах

Zaikin A.A., Borg Y., Ullner E., Alagha A., Alsaedi A., Nesbeth D. Complex and Unexpected dynamics in Simple Genetic Regulatory Networks // International Journal of Modern Physics B. V. 28. 2014. P. 1430006.

Zaikin A.A., Bates R., Blyuss O. Stochastic resonance in an intracellular genetic perceptron // Phys. Rev. E. V. 89. 2014. P. 032716.

Контакты

©  Нижегородский государственный университет им. Н.И. Лобачевского